DB41/T 1422-2017 蝴蝶兰建兰花叶病毒实时荧光RT-PCR检测方法
DB41/T 1422-2017
基本信息
发布历史
-
2017年07月
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研制信息
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- 起草人:
- 出版信息:
- 页数:8页 | 字数:- | 开本: -
内容描述
ICS65.020.01
B16
DB41
河南省地方标准
DB41/T1422—2017
蝴蝶兰建兰花叶病毒实时荧光RT-PCR
检测方法
2017-07-07发布2017-10-07实施
河南省质量技术监督局发布
DB41/T1422—2017
前 言
本标准参照SN/T2155—2008给出的规则编写。
本标准由河南省农业科学院提出并归口。
本标准起草单位:河南省农业科学院园艺研究所。
本标准主要起草人:王利民、蒋卉、董晓宇、符真珠、张和臣、王慧娟、李艳敏。
本标准参加起草人:高杰、张晶、袁欣。
I
DB41/T1422—2017
蝴蝶兰建兰花叶病毒实时荧光RT-PCR检测方法
1范围
本标准规定了蝴蝶兰建兰花叶病毒(Cymbidiummosaicvirus)实时荧光RT-PCR检测的术语和定义、
方法原理、仪器、用具、试剂、引物和检测方法。
本标准适用于蝴蝶兰植株建兰花叶病毒实时荧光RT-PCR的检测。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。
凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改)适用于本文件。
SN/T2155—2008建兰花叶病毒检测方法
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
建兰花叶病毒
建兰花叶病毒(CymbidiumMosaicVirus,CymMV),为马铃薯X病毒属(Potexvirus)病毒,该病
毒的分类地位、粒体结构、理化性质、基因组结构、传播方式参见附录A和SN/T2155—2008。
4方法原理
建兰花叶病毒为ssRNA病毒,通过反转录酶和DNA聚合酶的作用将RNA反转录为cDNA,针对核酸保守
序列设计引物,对cDNA进行PCR扩增,分析PCR检测结果,可明确材料中是否含有病毒的核酸成分。采用
实时荧光RT-PCR方法,可实时监测每次扩增中特异性序列扩增的目的片段累积量,荧光信号随时间变化
形成一条曲线。通常在10个~15个循环的荧光值设定阈值和基线,荧光产生进入指数期、线性期和最终
的平台期,依次可以在PCR反应处于指数期的某一点上来监测PCR产物的量。荧光强度首次超过设定阈值
时PCR所需的循环次数为Ct值,与样本细胞中表达稳定、丰度较低的基因(内参基因,如Actin、GAPDH
等)的Ct值进行相对定量分析,检测目的RNA片段的相对含量。
5仪器、用具、试剂及引物
5.1仪器
实时荧光PCR仪(本检测方法适用于ABI、Bio-Rad、Roche的实时荧光PCR仪)、高速冷冻离心机、
漩涡震荡仪、核酸蛋白测定仪、-20℃冰箱、-80℃超低温冰箱、高压灭菌锅、制冰机等。
5.2用具
1
DB41/T1422—2017
移液枪、移液枪头、离心管、PCR板、研钵等。
5.3试剂
所用试剂参见附录B。
5.4引物
蝴蝶兰建兰花叶病毒的实时荧光RT-PCR特异性引物为Cymv-F:5’-TGCCAGACGGTGCTATCGTA-3’、
Cymv-R:5’-AGAAAGGTGGAAGAGGTCGTTG-3’,扩增获得目的片段大小为182bp。
蝴蝶兰实时荧光RT-PCR内参引物为PeActin-F:5’-CTCTTTCACAACCACTGCGG-3’、PeActin-R:5’
-TGGGCACCTAAATCTCTCAGC-3’,扩增获得目的片段大小为181bp。
6检测方法
6.1样品采集
取蝴蝶兰的心叶叶尖部位5g作为待检测样品,所取得样品及时进行检测或-60℃以下低温保存。
6.2RNA提取
6.2.1加入1.5mLTrizol至2mL离心管中备用。
6.2.2取1
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