DB41/T 1422-2017 蝴蝶兰建兰花叶病毒实时荧光RT-PCR检测方法

DB41/T 1422-2017

河南省地方标准 简体中文 废止 页数:8页 | 格式:PDF

基本信息

标准号
DB41/T 1422-2017
标准类型
河南省地方标准
标准状态
废止
中国标准分类号(CCS)
国际标准分类号(ICS)
发布日期
2017-07-07
实施日期
2017-10-07
发布单位/组织
河南省质量技术监督局
归口单位
-
适用范围
-

发布历史

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研制信息

起草单位:
起草人:
出版信息:
页数:8页 | 字数:- | 开本: -

内容描述

ICS65.020.01

B16

DB41

河南省地方标准

DB41/T1422—2017

蝴蝶兰建兰花叶病毒实时荧光RT-PCR

检测方法

2017-07-07发布2017-10-07实施

河南省质量技术监督局发布

DB41/T1422—2017

前  言

本标准参照SN/T2155—2008给出的规则编写。

本标准由河南省农业科学院提出并归口。

本标准起草单位:河南省农业科学院园艺研究所。

本标准主要起草人:王利民、蒋卉、董晓宇、符真珠、张和臣、王慧娟、李艳敏。

本标准参加起草人:高杰、张晶、袁欣。

I

DB41/T1422—2017

蝴蝶兰建兰花叶病毒实时荧光RT-PCR检测方法

1范围

本标准规定了蝴蝶兰建兰花叶病毒(Cymbidiummosaicvirus)实时荧光RT-PCR检测的术语和定义、

方法原理、仪器、用具、试剂、引物和检测方法。

本标准适用于蝴蝶兰植株建兰花叶病毒实时荧光RT-PCR的检测。

2规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。

凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改)适用于本文件。

SN/T2155—2008建兰花叶病毒检测方法

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件。

3.1

建兰花叶病毒

建兰花叶病毒(CymbidiumMosaicVirus,CymMV),为马铃薯X病毒属(Potexvirus)病毒,该病

毒的分类地位、粒体结构、理化性质、基因组结构、传播方式参见附录A和SN/T2155—2008。

4方法原理

建兰花叶病毒为ssRNA病毒,通过反转录酶和DNA聚合酶的作用将RNA反转录为cDNA,针对核酸保守

序列设计引物,对cDNA进行PCR扩增,分析PCR检测结果,可明确材料中是否含有病毒的核酸成分。采用

实时荧光RT-PCR方法,可实时监测每次扩增中特异性序列扩增的目的片段累积量,荧光信号随时间变化

形成一条曲线。通常在10个~15个循环的荧光值设定阈值和基线,荧光产生进入指数期、线性期和最终

的平台期,依次可以在PCR反应处于指数期的某一点上来监测PCR产物的量。荧光强度首次超过设定阈值

时PCR所需的循环次数为Ct值,与样本细胞中表达稳定、丰度较低的基因(内参基因,如Actin、GAPDH

等)的Ct值进行相对定量分析,检测目的RNA片段的相对含量。

5仪器、用具、试剂及引物

5.1仪器

实时荧光PCR仪(本检测方法适用于ABI、Bio-Rad、Roche的实时荧光PCR仪)、高速冷冻离心机、

漩涡震荡仪、核酸蛋白测定仪、-20℃冰箱、-80℃超低温冰箱、高压灭菌锅、制冰机等。

5.2用具

1

DB41/T1422—2017

移液枪、移液枪头、离心管、PCR板、研钵等。

5.3试剂

所用试剂参见附录B。

5.4引物

蝴蝶兰建兰花叶病毒的实时荧光RT-PCR特异性引物为Cymv-F:5’-TGCCAGACGGTGCTATCGTA-3’、

Cymv-R:5’-AGAAAGGTGGAAGAGGTCGTTG-3’,扩增获得目的片段大小为182bp。

蝴蝶兰实时荧光RT-PCR内参引物为PeActin-F:5’-CTCTTTCACAACCACTGCGG-3’、PeActin-R:5’

-TGGGCACCTAAATCTCTCAGC-3’,扩增获得目的片段大小为181bp。

6检测方法

6.1样品采集

取蝴蝶兰的心叶叶尖部位5g作为待检测样品,所取得样品及时进行检测或-60℃以下低温保存。

6.2RNA提取

6.2.1加入1.5mLTrizol至2mL离心管中备用。

6.2.2取1

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