DB6528/T 189-2023 加工辣椒品种InDel指纹数据库构建规范

ICS67.080.01

CCSB31

6528

巴音郭楞蒙古自治州地方标准

DB6528/T189—2023

加工辣椒品种InDel指纹数据库构建规范

ProcessingpeppervarietiesInDelfingerprintdatabaseconstruction

specification.

2023-08-01发布2023-08-15实施

巴音郭楞蒙古自治州市场监督管理局  发布

DB6528/T189—2023

目次

前言II

1范围1

2规范性引用文件1

3术语和定义1

4InDel标记鉴定程序2

5标记类型及标记来源2

6检测方法2

7质量保证2

DNA质量2

引物序列2

酶及PCR反应相关试剂3

PCR扩增反应3

8样品的来源及性质3

品种来源3

样品类型3

样品分析数量3

9引物及流程的评估3

评估用的品种数量及名单的确定3

引物评估的取舍4

10不同来源数据的有效整合4

固定一套核心引物4

提供标准品的要求4

提供标准DNA的要求4

确定引物等位基因BIN的要求4

异常带型的数据处理方式4

数据的编码方式4

11构建品种DNA指纹模式库5

12构建品种DNA指纹扩展库5

13数据库数据的随机盲测5

I

DB6528/T189—2023

前言

本文件按照GB/T1.1—2020《标准化工作导则第1部分：标准化文件的结构和起草规则》的规定

起草。

本文件由新疆巴音郭楞蒙古自治州农业农村局提出并归口。

本文件起草单位：新疆巴音郭楞蒙古自治州农业科学研究院、新疆维吾尔自治区农业科学研究院园

艺所。

本文件主要起草人：张建文、张国儒、杨生保、唐亚萍、杨涛、李辉玲、帕提古丽·艾斯穆托拉、

火顺利、董洁、叶远荣。

本文件实施应用中的疑问，请咨询新疆巴音郭楞蒙古自治州农业科学研究院。

对本文件的修改意见或建议，请反馈至新疆巴音郭楞蒙古自治州农业农村局（新疆库尔勒市石化大

道64号小区）、新疆巴音郭楞蒙古自治州农业科学研究院（新疆库尔勒市英下路巴州农科院）、新疆维

吾尔自治区农业科学研究院园艺所（新疆乌鲁木齐市沙依巴克区新疆南昌路403号）、新疆巴音郭楞蒙

古自治州市场监督管理局（新疆库尔勒市延安路27-1号）。

新疆巴音郭楞蒙古自治州农业科学研究院联系电话：0996-2695780；邮编：841000

新疆维吾尔自治区农业科学研究院园艺所联系电话：0991-4590390；邮编：830091

新疆巴音郭楞蒙古自治州市场监督管理局联系电话：0996-2266036；邮编：841000

II

DB6528/T189—2023

加工辣椒品种InDel指纹数据库构建规范

1范围

本文件规定了加工辣椒品种InDel标记方法及标记来源、检测方法、质量保证、样品的来源及性质、

引物及流程的评估、不同来源数据的有效整合、构建品种DNA指纹模式库、构建品种DNA指纹扩展库、数

据库数据的随机盲测的要求。

本文件适用于加工辣椒品种鉴定及DNA指纹库的建立。

2规范性引用文件

本文件没有规范性引用文件。

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件。

InDel标记Insertion-deletion

根据基因组中插入缺失位点，设计一些扩增这些插入缺失位点的PCR引物，这就InDel标记。

DNA指纹DNAfingerprint

具有完全个体特异的DNA多态性，同个体核DNA的酶切片段杂交，获得了由多个位点上的等位基因组

成的长度不等的杂交带图纹。

变性聚丙烯酰胺凝胶电泳PAGEPolyacrylamidegelelectrop